Действие Warhead разворачивается параллельно оригиналу на всё том же тропическом острове. На сей раз наводить порядок будет сержант Майкл Сайкс по прозвищу Псих – один из бойцов отряда специального назначения Raptor. Без особых предисловий, а также не утруждая себя напоминанием о событиях Crysis, сюжет сразу же представляет нам героя, который лихо расправляется с многочисленными корейскими военнослужащими, не забывая при этом демонстрировать способности своего нанокостюма.